Да, всё верно. Эту папку надо периодически чистить вручную.
То же пробовал разные варианты, что находил в инете.. не помогает. У меня 8 ядер и 16 оперативки. Вылеты только из за движка. Только чаще сохранятся или чистить мод от всяких примочек, наподобие оригинального Sigerous 2.2
Хотя, как вариант.. можно попробовать распаковать все .db архивы и по новой запаковать уже вместе с модом, без лишних оригинальных файлов Зова Припяти. Может поможет. Ведь игра при загрузке читает оригинальные архивы, а потом gamedata с модом. И так каждый раз, при загрузке следующей локации.